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基于数字签名与Trie的OPSM索引与约束查询

大小:2.48 MB 人气: 2017-12-27 需要积分:3

  目前,基因芯片技术飞速发展,促使生物学家积累了大量的不同实验条件下的基因表达数据.事实证明,基因芯片数据分析在理解基因功能、基因调控和分子生命过程中发挥着重要作用.保序子矩阵(order-preserving submatrix,简称OPSM)是基因芯片数据分析技术中的一种有效模型,其可以发现在部分基因和不同实验条件下具有相同表达趋势的聚类.在分析基因表达机理的过程中,OPSM的检索无疑节省了生物学家的时间与精力.目前,OPSM的查询主要是基于关键词的检索方法,但是分析者对结果具有微弱的控制力,通常,分析者所能决定的临时的参数设置往往偏离其领域知识。致使检索结果与真实想要的结果相去甚远.为了解决上述问题。提出两类基于数字签名与Trie的OPSM索引与约束查询方法.在真实数据上进行了大量的实验,实验结果表明,所提出的方法具有良好的有效性与可扩展性。
 

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