COVID-19新冠病毒目前还没有特效药,全球都在加紧研发对应的药物及疫苗。为了加快药物研发,美国启用了目前全球最强的超算Summit,每秒浮点性能可达20亿亿次。
Summit超算位于美国橡树岭国家实验室,2017年底落成,从2018年上半年开始一直位列TOP500超算第一,终结了中国天河2号/太湖之光超算保持的10连冠,不出意外的话今年的2次TOP500冠军还是它。
Summit超算使用了IBM Power 9处理器及NVIDIA的Tesla V100加速卡,每个节点2组22核Power 9处理器及6组Tesla V100加速卡,单节点性能42TFLOPS,峰值浮点性能200PFLOPS(20亿亿次),Linpack性能也有143PFLOPS。
在超算的应用领域中,分子动力学是最需要强大运算性能的研究了,此前Summit超算也跑过老年痴呆、阿片类药物成瘾之类的运算,这次研究人员用它来模拟新冠病毒与不同化合物的反应。
据报道,这项研究已经针对8000多种有可能跟病毒蛋白结合的物质做了模拟测试,Summit超算筛选出77个可能有用的化合物,并根据测试结果做了排序。
不过超算的测试结果现在还只是参考,真正确定药物是否有效还需要很复杂的过程。
责任编辑:wv
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