为了检测引起新冠病毒肺炎(COVID-19)的SARS-CoV-2病毒,Oxford Nanopore Technologies公司正在着手开发一种快速且低成本的检测。目前,这种名为LamPORE的检测已进入开发的后期阶段。
LamPORE检测是基于Oxford Nanopore的DNA/RNA测序技术,而样本制备则采用了环介导等温扩增(LAMP)技术以及Oxford Nanopore的快速建库试剂盒。它能够检测样本中是否含有SARS-CoV-2病毒。
自从SARS-CoV-2病毒出现以来,Oxford Nanopore的快速便携式测序技术已大量用于COVID-19的流行病学和科学研究。LamPORE是该公司内部开发的首个检测产品,可在GridION或MinION测序设备上运行。
LAMP技术本身已被用于病毒的检测,可根据颜色来判断结果,但在大规模运行时基于颜色的结果判断颇具挑战性。LamPORE将成熟的LAMP方法与Oxford Nanopore测序技术相结合,可获得精确的数字结果。同时,这项检测不依赖于现有的检测硬件和试剂。众所周知,目前全球都面临RT-qPCR设备和试剂的短缺。
LamPORE检测不仅快速,还具有可扩展性,可同时运行多个样本。利用便携式的MinION测序设备,大约1小时可分析96个样本,在4.5小时内可分析1,152个样本。若利用台式的GridION测序设备,在同样的时间内能够处理五倍数量的样本。该检测适用于鼻咽拭子或唾液样本。
据介绍,LamPORE方法还有进一步开发的潜力,有望同时检测包括SARS-CoV-2病毒在内的多种病原体。随着时间的推移,当COVID-19的患病率下降,而其他呼吸道病原体的患病率上升时,这有望发挥作用。
LamPORE检测可以在实验室内集中开展,应用于一线员工的例行检查或复工后的大规模检查。同时,它也可以部署在本地化环境中,比如养老院、交通枢纽、企业或其他社区环境。快速的周转流程对于迅速隔离疑似患者和防止病毒继续传播特别重要。
Oxford Nanopore首席执行官Gordon Sanghera博士表示:“我们设计的首款纳米孔测序仪可被任何科学家在任何地方使用。现在,借助LamPORE,我们希望将纳米孔测序的普适性和可扩展性引入快速分析领域。”
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原文标题:Oxford Nanopore开发出快速且低成本的新冠检测产品
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