0
  • 聊天消息
  • 系统消息
  • 评论与回复
登录后你可以
  • 下载海量资料
  • 学习在线课程
  • 观看技术视频
  • 写文章/发帖/加入社区
会员中心
创作中心

完善资料让更多小伙伴认识你,还能领取20积分哦,立即完善>

3天内不再提示

Device Studio支持的文件类型及结构建模5.1-5.3的内容

鸿之微 来源:鸿之微 作者:鸿之微 2022-07-12 14:44 次阅读

Device Studio(简称:DS)作为鸿之微的材料设计与仿真软件,能够进行电子器件的结构搭建与仿真;能够进行晶体结构和纳米器件的建模;能够生成科研计算软件 Nanodcal、Nanoskim、MOMAP、RESCU、DS-PAW、BDF、STEMS、TOPS、PODS、VASP、LAMMPS、QUANTUM ESPRESSO、Gaussian的输入文件并进行存储和管理;可以根据用户需求,将输入文件传递给远程或本地的计算机进行计算,并控制计算流程;可以将计算结果进行可视化显示和分析。

上一期的教程给大家介绍了Device Studio基本简介和新手快速入门指南及图形界面,本期将介绍Device Studio支持的文件类型及结构建模5.1-5.3的内容。

4.支持的文件类型

Device Studio支持的文件类型有.hzw、.xyz、.cif、.xsd、scf.input、.py、POSCAR、CONTCAR等,其中.hzw为Device Studio特有文件格式。Device Studio可根据用户需要导出.hzw、.xyz格式的结构文件,并可将结构文件的3D可视化结果以.png图片格式导出;对于晶体结构,可识别其空间群结构信息,并导出.cif格式的结构文件。

5.结构建模

Device Studio支持从本地或在线数据库导入结构,或在导入结构的基础上搭建新的结构,支持创建各种分子、晶体和LCR/LR/FCB/FB/BCT/BT等典型的器件结构。Device Studio可根据用户提出的匹配精度要求,自动劈裂晶面,并进行匹配搭建器件结构,可以自动匹配搭建多层膜器件或晶体结构。

5.1.导入结构

导入结构前需要创建新项目或打开已建项目,在存在项目的基础上导入结构。创建项目的操作为:双击Device Studio图标快捷方式登录并启动软件,其图形界面如图5.1-1所示,根据界面提示选择创建一个新的项目(Create a new Project)或打开一个已经存在的项目(Open an existing Project)的按钮,选中之后点击界面中的OK按钮即可。若选择创建一个新的项目,用户可根据需要给该项目命名,如本项目命名为DeviceStudio。

b7c82522-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-1: 启动软件后选择创建或打开项目的图形界面

5.1.1.本地数据库导入结构

Device Studio自带本地数据库,该数据库包含500多种常用或热门材料,后期将会不断更新壮大数据库,若用户需大量级数据库,可关注鸿之微软件FIRST,该软件内置了三大数据库QuickMol、QuickCrystal和ACED,材料条目超过1000万。用户可通过本地数据库导入结构,如导入ZnO-MgO-Si器件结构,其导入结构的操作如图5.1-2红色部分所示:File→Import→Import Local,之后弹出图形界面如图5.1-3所示,根据界面提示在本地数据库中找到ZnO-MgO-Si所在的文件夹,选中ZnO-MgO-Si结构文件,点击图5.1-3中的打开按钮即可导入ZnO-MgO-Si结构,导入ZnO-MgO-Si结构后的图形界面如图5.1-4所示,其中ZnO-MgO-Si.hzw结构文件在 Project Explorer(项目管理)区域,结构的3D视图显示在3D Viewer(3D显示)区域。

若不想通过数据库导入结构,知道结构文件的位置,如ZnO-MgO-Si结构,直接鼠标左击选中该结构文件,拖动到Device Studio的Project Explorer(项目管理)区域即可导入该结构,同时其结构的3D视图显示在3D Viewer(3D显示)区域。

b7e36198-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-2: 弹出本地数据库导入结构操作界面

b809c022-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-3: 选中ZnO-MgO-Si结构文件界面

b8305a5c-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-4: 导入ZnO-MgO-Si结构后的Device Studio界面

5.1.2.在线数据库导入结构

Device Studio支持连接在线数据库Materials Project,如图5.1-5红色部分所示:点击File→Import→Import Online则弹出从Materials Project数据库导入结构的界面,在该界面中用户可通过输入元素、化学式或mp序号的方式来搜索原子结构。

b85a0212-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-5: 弹出在线数据库导入结构操作界面

如图5.1-6所示,通过输入元素来搜索结构,输入Si元素,点击Search按钮或点击键盘Enter键,则出现很多只含有Si元素的原子结构,如Si4结构,左边为其详细的化学式,右边为其对应的空间群结构,选中之后可在界面左下角红色框区域查看该结构的化学式、空间群对称信息以及原子坐标等详细信息;可在界面右下角红色框区域查看到该结构的3D显示。对于结构的3D显示,可通过滚动鼠标中键将3D显示结果放大或缩小;可鼠标右键选中该结构,通过拖动鼠标来将3D视图显示结果进行旋转,确定好搜索的原子结构后点击界面中的Add按钮则可将该原子结构导入,其结构文件保存在软件的项目管理区域(Project Explorer),同时可在3D显示区域查看到该原子结构的3D视图显示,通过在线数据库Materials Project导入Si4结构后的Device Studio界面如图5.1-7所示。

b87e8600-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-6: Materials Project元素搜索并导入结构的操作界面

b89976ea-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-7: 导入Si4结构后的Device Studio界面

通过化学式、mp序号来搜索并导入结构的操作与通过元素搜索并导入结构的操作一致,其操作界面分别如图5.1-8、5.1-9所示。

b8bf2750-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-8: Materials Project化学式搜索并导入结构的操作界面

b8e1ab04-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

图5.1-9: Materials Project mp序号搜索并导入结构的操作界面

5.2.2D分子建模

Device Studio 2022A版新增2D分子建模功能,在2D分子建模的界面中,其工具栏包含绘制分子结构式的多种键和工具,包括化学键、环形模板、折叠链、船式结构、椅式结构、箭头、边框以及文本编辑工具等,用户可通过该功能快捷方便的绘制各种2D平面分子结构式和编写方程式,并支持将2D分子结构转化为3D分子结构。

Device Studio具有对2D分子结构进行编辑的功能,用户可对分子结构进行旋转、修改键宽、键长、键位颜色、键位类型、键位属性转换、加氢、减氢、加电荷、减电荷等操作。

以搭建3个相连苯环的2D分子结构并将其转换为对应的3D分子结构为例,其搭建步骤如图5.2-1所示。

b9026998-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(a): 弹出2D分子建模界面操作

b921362a-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(b): 2D分子建模界面

b93edda6-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(c): 搭建2D分子结构并转换为3D分子结构操作

b95d63b6-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(d): 2D分子结构转换为3D分子结构后的Device Studio界面

b97feab2-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(e): 优化转换后的3D分子结构操作

图5.2-1: Device Studio搭建2D分子结构并将其转换为对应的3D分子结构的操作步骤

5.3.3D分子建模

Device Studio 2022A版新增3D分子建模功能,用户可通过该功能方便快捷的搭建3D分子结构,Device Studio支持对3D分子结构进行编辑,并可查看分子结构的原子坐标和原子之间成键的详细信息,可对分子结构进行共键调整、原子夹角调整、二面角调整、加氢、平移、旋转、重命名、复制片段、增、删、改等一系列操作。Device Studio搭建3D分子结构的操作界面如图5.3-1所示。

b9a955fa-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(a): 弹出3D分子建模界面操作

b9c18a8a-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(b): 3D分子建模界面

b9df222a-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(c): 搭建3D分子结构操作一

ba04b4d6-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(d): 搭建3D分子结构操作二

ba6cf01e-00fd-11ed-ba43-dac502259ad0.png

(e): 优化搭建好的3D分子结构

图5.3-1: Device Studio搭建3D分子结构的操作步骤

审核编辑 :李倩

声明:本文内容及配图由入驻作者撰写或者入驻合作网站授权转载。文章观点仅代表作者本人,不代表电子发烧友网立场。文章及其配图仅供工程师学习之用,如有内容侵权或者其他违规问题,请联系本站处理。 举报投诉
  • 结构
    +关注

    关注

    1

    文章

    117

    浏览量

    21570
  • 可视化
    +关注

    关注

    1

    文章

    1178

    浏览量

    20892

原文标题:产品教程|Device Studio支持的文件类型及结构建模01

文章出处:【微信号:hzwtech,微信公众号:鸿之微】欢迎添加关注!文章转载请注明出处。

收藏 人收藏

    评论

    相关推荐

    微软Copilot Studio新功能:支持定制Agent 赋能用户构建自主智能体

    微软宣布重大更新,用户可通过Microsoft Copilot Studio构建自主智能体。麦肯锡、汤森路透等全球知名企业己利用智能体,实现了效率飞跃与业务升级。智能体拥有自主行动能力,能灵活配置并
    的头像 发表于 11-10 09:59 503次阅读
    微软Copilot <b class='flag-5'>Studio</b>新功能:<b class='flag-5'>支持</b>定制Agent 赋能用户<b class='flag-5'>构建</b>自主智能体

    【米尔NXP i.MX 93开发板试用评测】3、NXP的MCU工程目录结构和源码分析

    ,如Unix的Makefile或Windows的Visual Studio工程文件。CMake支持多种编程语言,包括C、C++、Fortran、Java和Python等,并且可以与多种编译器和开发
    发表于 09-21 21:11

    RT-Thread Studio构建和重新构建的不同,一般我们编译工程时用哪个?

    想请教在RT-Thread Studio中,构建和重新构建的不同,一般我们编译工程时用哪个,谢谢!
    发表于 07-25 07:38

    新架构下服务建模,关键在这6步!

    经纬恒润基于SystemWeaver平台,按照SOA建模理念为客户提供了新一代基于SOA的企业级电子电气系统协同设计解决方案,可以有效支持服务和信号的混合架构建模
    的头像 发表于 07-08 10:36 1304次阅读
    新架构下服务<b class='flag-5'>建模</b>,关键在这6步!

    请问CYW20719是否支持任何BT5.3功能?

    CYW20719 是否支持任何 BT5.3 功能? 定期广告中的 AdvDataInfo 加密密钥大小控制增强功能 LE 增强连接更新 LE 信道分类 取消备用 MAC 和 PHY (AMP) 扩展
    发表于 07-05 07:24

    3D建模的重要内容和应用

    3D建模是一种技术,通过计算机软件创建虚拟三维模型,模拟现实世界中的物体或场景。这项技术广泛应用于建筑设计、电影制作、游戏开发、工程仿真等领域。下面古河云科技将介绍一些与3D建模相关的重要内容
    的头像 发表于 06-21 14:48 571次阅读

    esp32-s3蓝牙仅支持BLE 5.0吗?

    1. esp32-s3蓝牙仅支持BLE 5.0吗?经典蓝牙是否支持,以及BLE 5.1 5.2 5.3是否支持 2. 如何选择1M 或2M
    发表于 06-13 06:48

    请问managed_components文件夹下的组件怎么被构建进项目中?

    之前一直在用旧版本,最近下载了esp_idf的新版本,发现项目目录下文件结构发生了一些变化,引入了idf component manager工具,所有依赖的组件都被下载
    发表于 06-13 06:40

    Aurix Development Studio构建Autosar MCAL FW,构建\"IfxGtm_reg.h\" 时总是出错怎么解决?

    我使用 Aurix Development Studio构建 Autosar MCAL FW,在构建\"IfxGtm_reg.h\" 时总是出错。 \"- 语法错误
    发表于 05-29 07:34

    鸿蒙开发【编译构建】讲解

    Version 4~7工程编译构建示意图如下: 另外,针对Native C++开发方式,DevEco Studio支持的编译工具链为CMake和NinJa,在启动编译后,可以在底部工具栏窗口的输出
    发表于 02-27 17:41

    Simplicity Studio 5扩增功能支持以VS Code开发

    应用程序开发的支持。此一功能扩展可让开发人员在VSCode生态系统中构建、刷新和调试。用户可以使用VS Code作为主要的IDE,同时仍然能够使用熟悉和喜爱的项目配置图形界面。在Simplicity Studio中配置、设置和生
    的头像 发表于 01-29 10:34 878次阅读
    Simplicity <b class='flag-5'>Studio</b> 5扩增功能<b class='flag-5'>支持</b>以VS Code开发

    studio创建lib文件及使用

    studio创建lib文件及使用
    的头像 发表于 01-18 08:06 428次阅读
    e² <b class='flag-5'>studio</b>创建lib<b class='flag-5'>文件</b>及使用

    鸿蒙南向开发—OpenHarmony技术编译构建框架

    概述 OpenHarmony编译子系统是以GN和Ninja构建为基座,对构建和配置粒度进行部件化抽象、对内建模块进行功能增强、对业务模块进行功能扩展的系统,该系统提供以下基本功能: 以部件为最小
    发表于 01-04 16:47

    蓝牙5.15.3有什么区别?

    蓝牙5.15.3有什么区别? 蓝牙5.15.3是蓝牙无线技术的两个版本,它们在一些方面有所不同。下面将详细介绍蓝牙5.1
    的头像 发表于 12-09 15:06 1.7w次阅读

    oracle配置文件类型关联

    Oracle是一种业界领先的关系型数据库管理系统,它在大型企业中被广泛使用。Oracle的配置文件对于数据库的稳定运行和性能优化至关重要。在这篇文章中,我们将详细讨论Oracle的一些重要配置文件
    的头像 发表于 12-06 10:17 463次阅读