0
  • 聊天消息
  • 系统消息
  • 评论与回复
登录后你可以
  • 下载海量资料
  • 学习在线课程
  • 观看技术视频
  • 写文章/发帖/加入社区
会员中心
创作中心

完善资料让更多小伙伴认识你,还能领取20积分哦,立即完善>

3天内不再提示

无需扫描! SPINDLE可实现3D高精度单分子定位成像!

昊量光电 来源:昊量光电 作者:昊量光电 2022-07-25 10:50 次阅读

介绍

超分辨率显微成像是一系列能够使研究人员能够“打破”光学显微镜衍射障碍的方法,在该系列方法中分辨率最高的技术为光激活定位显微技术(PALM)。这些方法依赖于在数千帧中对单个分子的随机子集进行定位(SMLM),并将这些个体的定位重构为单个超分辨率图像。传统的定位显微镜可以在横向维度上进行10~20nm的精确成像,为了实现更高的定位精度,要求显微镜配置具有更高信噪比的灵敏探测器。尽管横向分辨率令人印象深刻,但传统的2DSMLM仍通常缺乏轴向分辨率。

美国DoubleHelixOptics公司的SPINDLER系列3D显微镜成像模块与3DTRAXR软件相结合,可在三维尺度上实现高精度、亚衍射极限定位,并具有扩展的深度成像能力。SPINDLE采用精密光学器件设计,可与市面上在售的科学显微镜无缝集成,并提供前所未有的横向和轴向精密成像组合。用户可根据具体的应用选择合适的相位掩模版以实现基于深度范围、发射波长和信噪比等参数对点扩散函数(PSF)的优化,更重要的是,SPINDLE可在无需扫描的情况下在单张图像中将传统成像系统的景深扩大10倍。

在本文中,我们展示了如何将SPINDLE成像系统与传统荧光显微镜结合使用以在所有三个维度(x、y、z)上实现亚衍射极限成像。SPINDLE可与任何高质量的科学相机兼容,无论是emccd还是scmos都可以提供定位显微镜所需的高信噪比图像。

使用SPINDLE和DH-PSF相位掩模版对细胞微管进行三维超分辨成像

在本文中,我们证明了使用SPINDLE单通道模块可以实现高精度、大深度的超分辨率重建。如图1所示,使用Double Helix (DH-PSF) 的相位掩模版与SPINDLE单分子定位显微镜组件结合。系统将单个分子发出的光分成两个光瓣,通过找到两个光瓣的中心来检索发光点的横向(x-y)位置;两光瓣之间的角度编码了发光点的轴向(z)位置。这些额外的信息将有助于在横向和轴向尺寸上以非常高的精度(<20nm)进行超分辨率重建。此外,SPINDLE扩展了分子可以定位的景深,这种精确度和扩展深度成像的结合能够以显着提高的z轴分辨率以收集更多的数据。

pYYBAGLeAqiAeIrTAAGulOFNigc129.png

图1:基于单分子定位显微成像技术(SMLM)技术的带有可互换相位掩模支架的SPINDLE模块

为了演示SPINDLE的工作原理,我们使用NikonN-STORM显微镜结合PhotometricsPrime95B相机对被AlexaFluor647偶联微管蛋白抗体标记的Cos7细胞进行了成像。对于该样品,我们使用经过优化的相位掩模版,该掩模版可与远红外波长染料和1.49NA的100倍物镜配合使用。样品在640 nm激光连续照射下在Prime95B上成像,曝光时间为30 ms。使用3DTRAX软件对单发射点进行定位,并将结果导出到ImageJ插件Thun-derSTORM。使用归一化高斯方法重建图像,并使用ImageJ查找表“Spectrum”以颜色对z深度进行编码。

poYBAGLeAuqATpWvAAAxHk1A45E545.png

图2:单个100nm珠在Prime95B上使用SPINDLE在焦平面(0µm)和焦平面上方(+1µm)和下方(-1µm)微米处的成像图

重建的结果包含超过200万个定位,并显示Cos7细胞中微管的30µmx30µm视野、深度超过2.1µm的范围(图3左)。深度以颜色编码,细胞底部为红色/紫色,顶部附近为黄色/橙色。放大的插图显示微管在一定深度范围内得到了很好的重建(图3,右)。这些数据突出了使用Double Helix SPINDLE模块带来的扩展景深成像和高横向和轴向分辨率。

使用Double Helix 3DTRAX软件进行高精度三维定位

DoubleHelix3DTRAX软件是一个ImageJ/FIJI插件,其可以在横向和轴向以亚衍射极限精度定位单个分子。3DTRAX还使用克拉美-拉奥下限(CRLB)5计算了每个定位分子的精度值。该计算基于每个定位的信噪比。

poYBAGLeAymAK7rdAAgT4Ab823E845.png

图3:使用SPINDLE(R)和Prime95B成像的微管三维超分辨率重建图。左图:Cos7细胞免疫染色的微管蛋白,颜色编码深度。右图:左侧图像的放大区域,显示了深度超过2微米的微管。图片由DoubleHelixOptics提供。平均CRLB值横向约10nm,轴向约20nm(图3)

概括

Double Helix的SPINDLE超分辨率3D显微成像模组、相位掩模和3DTRAX软件的组合可实现高精度大深度三维成像、跟踪和计数。在此应用中,我们在亚细胞结构的三维超分辨率重建中展示了大约10nm的横向精度和20nm的轴向精度。SPINDLE系列产品为研究人员提供了强大的工具集,可促进对广泛生物系统中分子结构、亚细胞和细胞内相互作用的理解。


poYBAGLeA2CAb-2GAABY6bHw5E0502.png

图4:横向和轴向精度。用于重建图2所示图像的定位精度值。精度值由3DTRAX软件根据其信噪比使用每个发射器的Cramer-Rao下界5计算得出。定位数显示在y轴上,精度值(nm)显示在x轴上

相关文献;

1.RustMJ,BatesM,ZhuangX.Sub-diffraction-limitimagingbystochasticopticalreconstructionmicroscopy(STORM).NatMethods.2006;3(10):793-796.doi:10.1038/nmeth929.

2.BetzigE,PattersonGH,SougratR,etal.Imagingintracellularfluorescentproteinsatnanometerresolution.Science.2006;313(5793):1642-1645.doi:10.1126/science.1127344.

3.JainS,WheelerJR,WaltersRW,AgrawalA,BarsicA,ParkerR.ATPase-ModulatedStressGranulesContainaDiverseProteomeandSubstructure.Cell.2016;164(3):487-498.doi:10.1016/j.

cell.2015.12.038.

4.WangD,AgrawalA,PiestunR,SchwartzDK.Enhancedinformationcontentforthree-dimensionallocalizationandtrackingusingthedouble-helixpointspreadfunctionwithvariable-angleilluminationepifluorescencemicroscopy.ApplPhysLett.2017;110(21):211107.doi:10.1063/1.4984133.

5.PavaniSRP,ThompsonMA,BiteenJS,etal.Three-dimensional,single-moleculefluorescenceimagingbeyondthediffractionlimitbyusingadouble-helixpointspreadfunction.ProcNatlAcadSci.2009;106(9):2995-2999.doi:10.1073/pnas.0900245106.

6.PavaniSRP,PiestunR.High-efficiencyrotatingpointspreadfunctions.OptExpress.

2008;16(5):3484.doi:10.1364/OE.16.003484.

7.XuK,BabcockHP,ZhuangX.Dual-objectiveSTORMrevealsthree-dimensionalfilamentorganizationintheactincytoskeleton.NatMethods.2012;9(2):185-188.doi:10.1038/nmeth.1841.

8.DempseyGT,VaughanJC,ChenKH,BatesM,ZhuangX.Evaluationoffluorophoresforoptimalperformanceinlocalization-basedsuper-resolutionimaging.NatMethods.2011;8(12):1027-1036.

doi:10.1038/nmeth.1768.

9.OvesnýM,KřížekP,BorkovecJ,ŠvindrychZ,HagenGM.ThunderSTORM:AcomprehensiveImageJplug-inforPALMandSTORMdataanalysisandsuper-resolutionimaging.Bioinformatics.

2014;30(16):2389-2390.doi:10.1093/bioinformatics/btu202.


关于Double Helix Optics

美国DoubleHelixOptics是一家位于美国科罗拉多州博尔德的计算光学公司。Double Helix Optics采用其专利的双螺旋光工程成像技术设计开发下一代高精度3D成像产品,广泛应用在生命科学和材料科学领域以实现对亚细胞结构3D的成像、跟踪和计数。

DoubleHelix的SPINDLE系列成像模块与可切换的相位掩模库以及用于计算重建和分析的软件相结合,确保为我们的客户及其应用的具体情况提供最高质量的3D成像技术。

关于昊量光电

昊量光电 您的光电超市!

上海昊量光电设备有限公司致力于引进国外先进性与创新性的光电技术与可靠产品!与来自美国、欧洲、日本等众多知名光电产品制造商建立了紧密的合作关系。代理品牌均处于相关领域的发展前沿,产品包括各类激光器、光电调制器、光学测量设备、精密光学元件等,所涉足的领域涵盖了材料加工、光通讯、生物医疗、科学研究、国防及前沿的细分市场比如为量子光学、生物显微、物联传感、精密加工、先进激光制造等。

我们的技术支持团队可以为国内前沿科研与工业领域提供完整的设备安装,培训,硬件开发,软件开发,系统集成等优质服务,助力中国智造与中国创造! 为客户提供适合的产品和提供完善的服务是我们始终秉承的理念!

审核编辑 黄昊宇

声明:本文内容及配图由入驻作者撰写或者入驻合作网站授权转载。文章观点仅代表作者本人,不代表电子发烧友网立场。文章及其配图仅供工程师学习之用,如有内容侵权或者其他违规问题,请联系本站处理。 举报投诉
  • 成像
    +关注

    关注

    2

    文章

    233

    浏览量

    30475
  • 显微镜
    +关注

    关注

    0

    文章

    558

    浏览量

    23021
收藏 人收藏

    评论

    相关推荐

    3D扫描与数字拓片:打造文化遗产的数字复本

    ,还可以做到真正的无接触、高精度。 数字拓片可以应用于打印复印、数字化展示、教育研究等方面。本文将带您走进数字拓片的世界,探索3D扫描技术如何为文物保护注入新的活力。 01 烟霞洞碑刻数字拓片
    的头像 发表于 10-31 17:22 185次阅读
    <b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>扫描</b>与数字拓片:打造文化遗产的数字复本

    3D扫描技术医疗领域创新实践,积木易搭3D扫描仪Mole助力定制个性化手臂康复辅具

    模式,医疗行业的服务质量、效率和体验迎来了全新的升级。 其中,3D扫描+3D打印技术在医疗领域的矫形修复、医疗辅助器具定制、口腔等众多医疗领域应用越来越广泛。有着高精度、非接触、高效率
    的头像 发表于 10-31 11:25 226次阅读
    <b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>扫描</b>技术医疗领域创新实践,积木易搭<b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>扫描</b>仪Mole助力定制个性化手臂康复辅具

    物联网系统中高精度RTK定位方案的实现_高精度定位模块

    物联网系统中为什么要使用高精度定位模块 物联网系统中使用高精度定位模块的原因主要体现在以下几个方面: 提高定位
    的头像 发表于 09-26 17:53 1160次阅读
    物联网系统中<b class='flag-5'>高精度</b>RTK<b class='flag-5'>定位</b>方案的<b class='flag-5'>实现</b>_<b class='flag-5'>高精度</b><b class='flag-5'>定位</b>模块

    广东三维扫描3D扫描电器零部件逆向工程3D建模抄数设备-CASAIM

    3D扫描
    中科院广州电子
    发布于 :2024年09月26日 09:35:35

    荣获2024德国红点奖!积木易搭第四代高精度消费级手持3D扫描仪Moose来袭

    日前,国内全栈式3D扫描解决方案提供商积木易搭在国内市场上新了新一代消费级手持3D扫描仪Moose,这也是积木易搭推出的第四代消费级手持3D
    的头像 发表于 08-28 17:25 345次阅读

    AT372-6P高精度定位模块datasheet

    频RTK模块是一种基于全球卫星导航系统(GNSS)的高精度定位技术模块,主要运用频接收器接收卫星信号,并结合基准站数据进行差分计算,以实现
    的头像 发表于 08-25 15:04 334次阅读
    AT372-6P<b class='flag-5'>单</b>频<b class='flag-5'>高精度</b><b class='flag-5'>定位</b>模块datasheet

    广东3D扫描钣金件外观尺寸测量3D偏差检测对比解决方案CASAIM

    3D扫描
    中科院广州电子
    发布于 :2024年07月22日 16:13:45

    什么是高精度定位平板?

    普通GPS设备的精度高精度定位平板的关键技术是RTK(Real-Time Kinematic,实时动态测量)技术。RTK技术通过接收来自基站的差分信号,实时修正GPS信号中的误差,实现
    的头像 发表于 06-12 17:53 812次阅读

    先临三维李仁举:自主研发引领驱动, 高投入推进本土高精度3D视觉创新

      高精度3D扫描仪于 智能制造 而言具有关键意义。        受益于技术不断进步,以及创新解决方案的持续推出,当前,高精度3D
    的头像 发表于 06-05 14:06 329次阅读
    先临三维李仁举:自主研发引领驱动, 高投入推进本土<b class='flag-5'>高精度</b><b class='flag-5'>3D</b>视觉创新

    头盔3D扫描逆向工程3d建模抄数测绘服务-CASAIM中科广电

    3D扫描
    中科院广州电子
    发布于 :2024年04月12日 14:03:01

    奥比中光与创想三维联合打造的高精度3D扫描仪正式发布

    4月9日,奥比中光与战略合作伙伴创想三维联合打造的高精度3D扫描仪CR-Scan Otter、CR-Scan Raptor正式发布。
    的头像 发表于 04-12 09:06 647次阅读

    新质生产力探索| AICG浪潮下的3D打印与3D扫描技术

    了Polymaker产品负责人黄宇立先生,知象光电华东区销售负责人奈斌先生和蘑菇云创客空间联合创始人夏青先生围绕以下话题进行了深入的探讨。 1.如何通过材料创新来应对3D打印中的常见挑战? 2.3D打印材料的未来趋势 3.
    的头像 发表于 04-01 09:28 413次阅读

    泰来三维| 高精度工业3D扫描助力模具检测和逆向设计“数字化”发展

    相应的,产品所需的模具结构也变得愈发复杂精密,传统检测方式和测绘工具很难满足些最新需求。高精度工业3D扫描技术的出现,通过获取工件完整的三维数据,为模具检测和逆向设计提供“数字化”破局之法。
    的头像 发表于 01-29 16:22 471次阅读
    泰来三维| <b class='flag-5'>高精度</b>工业<b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>扫描</b>助力模具检测和逆向设计“数字化”发展

    高精度彩色3D相机:开启崭新的彩色3D成像时代

    近年来,机器人技术的快速发展促使对3D相机技术的需求不断增加,原因在于,相机在提高机器人的性能和实现多种功能方面发挥了决定性作用。
    的头像 发表于 01-15 14:09 537次阅读
    <b class='flag-5'>高精度</b>彩色<b class='flag-5'>3D</b>相机:开启崭新的彩色<b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>成像</b>时代

    友思特分享 | 高精度彩色3D相机:开启崭新的彩色3D成像时代

    3D成像的新时代 近年来,机器人技术的快速发展促使对3D相机技术的需求不断增加,原因在于,相机在提高机器人的性能和实现多种功能方面发挥了决定性作用。然而,其中许多应用所需的解决方案更复
    的头像 发表于 01-11 09:57 416次阅读
    友思特分享 | <b class='flag-5'>高精度</b>彩色<b class='flag-5'>3D</b>相机:开启崭新的彩色<b class='flag-5'>3D</b><b class='flag-5'>成像</b>时代