困扰科学家近50年的蛋白质折叠难题
蛋白质是生命的物质基础,是组成人体一切细胞、组织的重要成分。无论是肌肉收缩、眼睛感光,还是消化食物等,人类的生命活动无时无刻都需要蛋白质的参与。
而蛋白质之所以功能丰富,很大程度得益于其独特的空间结构。可以说,想要更了解人本身,就需要破译每个蛋白质的复杂结构。然而,蛋白质中的长链氨基酸扭曲、折叠并交织成复杂的三维结构,为结构破译设下层层关卡,这才有困扰了科学家近50年的“蛋白质折叠难题”。
AI赋能蛋白质计算
随着科技革命和产业转型浪潮的推进,人工智能赋能科学研究的趋势势不可挡,蛋白质科学首当其冲。借助AI颠覆蛋白质结构预测,使分子生物学家从基于蛋白质氨基酸序列研究转变为用预测的结构分析蛋白质功能,影响了整个生物科学的研究范式。
最典型的就是人尽皆知的AlphaFold。DeepMind 宣布,人们首次发现了一种通过计算来预测蛋白质结构的方法。即使在不知道相似结构的情况下,AI 也可以在原子层面上精确预测蛋白质的结构,使得不可能变为可能。
DeepMind表示,AlphaFold 可以周期性地以原子精度预测蛋白质结构,利用多序列对齐和深度学习算法设计,结合关于蛋白质结构的物理和生物学知识提升预测效果。其突破性的研究成果广泛应用在生命学科各分支,是对结构生物学领域的一个颠覆性突破。
AI模型+曙光算力服务,蛋白质功能预测与设计未来可期
扩展来看,不只是对蛋白质结构预测的变革,AI 对整个科研领域还有大量的潜力等待挖掘,如 AI + 数学、AI + 化学、AI + 医药等,这些应用将帮助科研人员探索引发某些疾病的机制,并为设计药物、农作物增产研发铺平道路。
曙光智算作为智能计算时代的算力服务商,在“AI+Science”等领域持续深耕,已沉淀大量前沿实践经验,实现了对开发环境的快速部署。针对开发流程,对运算资源按照训练任务进行分割和分发,并额外支持容器镜像管理、权限管理、交互界面图形化等功能,以帮助用户更快速地介入人工智能领域,聚焦实际算法的优化和迭代,促进人工智能技术的快速落地。
审核编辑:汤梓红
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原文标题:曙光异构算力服务平台,加速蛋白质计算升级
文章出处:【微信号:sugoncn,微信公众号:中科曙光】欢迎添加关注!文章转载请注明出处。
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