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介绍一种业界受欢迎的分子克隆工具SnapGene

工程师邓生 来源:哲想软件 作者:哲想软件 2022-09-07 10:40 次阅读

用简单的方式来计划、可视化和记录您的日常分子克隆程序

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计划

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提高准确性,同时加快进程,节约你的时间和金钱

优雅、信息丰富的窗口,模拟常见克隆和PCR方法

清晰的示意图,让你清楚地看到不同构造如何组合在一起

SnapGene通过持续跟踪DNA甲基化和磷酸化等细节,助你识别并规避常见失误

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可视化

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凭借无与伦比的可视性和操控性,即使是克隆新手也能快速应对复杂任务

获得非凡的DNA及蛋白质序列的可视结果

创建和浏览带有丰富注释的质粒图,或扫描带有数千个注释特性的大型DNA序列

通过高度可视化的测序结果与模拟结构的比对,以确认克隆结果

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记录

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模拟程序的自动化归档,助你节省更多时间,并让分享和保存工作更轻松、更高效、也更有效

自动生成丰富的图形历史记录,轻松查看序列编辑和克隆程序

通过共享包含历史细节的完整结构,以增强协作、留存知识点

大胆尝试全面的“撤销”功能,追溯你的每一步

超越分子克隆的基础知识

SnapGene成为最受欢迎的克隆工具是有依据的,它快速、智能、非常友好。

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直观的技术可以识别克隆过程中的设计缺陷,从而纠正它们

使用您自己的引物模拟标准PCR,或允许SnapGene自动设计它们

专业的克隆工具确保所有主要分子克隆技术的快速准确构建设计

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验证您的项目设计并防止错误

自动查看质粒的特征

既可以用SnapGene自有的特征数据库,也可以用你的自定义特征在质粒上注释

在质粒图谱上或在序列视图上详细显示酶切位点、特征、引物、ORFs,翻译等信息

试试灵活注释和可视化控件,自定义你的图谱

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比对工具,方便检查你的序列

功能强大的“比对参考(Alignto Reference)”工具,帮你验证序列化结构与模拟结构是否匹配

使用可信赖的算法对序列进行成对/多重比对,涵盖ClustalOmega,MAFFT,MUSCLE和T-Coffee

通过CAP3,将Sanger法测序加入完整的重叠群(contigs)

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逼真模拟琼脂糖凝胶

凭借具有丰富经验的凝胶模拟算法,SnapGene能准确可视化你将在实验室中看到的情景

灵活配置所有凝胶元素,包括多个(电泳)泳道,琼脂糖%,运行时间以及全套MW标记

记录并识别你感兴趣的band,并提供每个(电泳)泳道的详细片段信息

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可配置为自动记录,数据交换非常轻松

自动创建图形化历史记录

直观地记录实验过程和文档变更

在历史记录、图谱、序列视图中显示历史记录颜色

嵌入在文档中的完全可恢复的序列历史

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转换和共享你的数据

存储、搜索、共享并组织你的序列、文件和图谱

与存储在可共享驱动器、服务器或云服务中的序列集合协同工作

轻松读取和导出许多常用文件格式的序列、注释和其他元数据

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产品特性

一起探索SnapGene的强大产品特性,增强你的日常分子克隆程序

分子克隆

限制性克隆

Gateway克隆

GibsonAssembly

NEBuilderHiFi组装

In-Fusion克隆

TAand GC 克隆

TOPO克隆

引物

设计引物

退火两个寡核苷酸以形成双链产物

PCR和诱变

模拟PCR

重叠延伸PCR

引物定向诱变

酶组

酶组

预定义酶组– 按群或切位

创建自定义酶组

查看酶的详细信息

对甲基化敏感性和相关错误预防提供多样支持

转换文件格式

AlignmentFormats

ApE

CLCBio

CloneManager

DNAStrider

DNADynamo

DNASIS

DNAssist

DNASTARLasergene

DSGene

EMBL(ENA)

EnzymeX

GenBank/ DDBJ

GeneConstruction Kit

Geneious

GeneTool

GenomeCompiler

Jellyfish

MacVector

pDRAW32

SerialCloner

Swiss-Prot

VectorNTI

VisualCloning

常规

跨平台兼容性– Windows,macOS, Linux

翻译

查看和编辑翻译后功能

开放性阅读框(ORFs)

完整序列翻译

检查基因融合框架

制作蛋白质(从DNA)

反向翻译(从蛋白质)

比对

将DNA序列与参考序列进行比对

验证克隆或突变

将cDNA与染色体比对

成对和多序列DNA和蛋白质比对

选择比对算法-Clustal Omega, MAFFT, MUSCLE, T-Coffee

重叠群组装

可视化

多个视图下查看DNA序列

大序列支持– 浏览染色体大小序列

编辑DNA和蛋白质序列

序列色码

历史记录

全面“撤销”功能

查看结果的图形历史

使用可选的历史颜色来识别序列中最近的更改

琼脂糖凝胶模拟

模拟琼脂糖凝胶

模拟限制酶切消化

模拟聚合酶链式反应扩增

大量收集MW标记

特性/注释

创建和编辑特性

常见特性自动注释

手动注释异常特性

选择其它密码子

特性转换的复杂编号

支持核糖体滑移

数据管理

从常用文件格式导入,包含注释和说明

导出标准格式

创建和共享集合

通过SnapGeneViewer共享数据

运行批处理操作

安全文件管理

寻找DNA或蛋白质序列

寻找酶、特性或引物



审核编辑:刘清

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原文标题:SnapGene:业界受欢迎的分子克隆工具

文章出处:【微信号:哲想软件,微信公众号:哲想软件】欢迎添加关注!文章转载请注明出处。

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