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系统硬件部分负责采集前端高速LVDS数据并通过PCI Express总线传输给计算机，以Xilinx公司MLS05开发板为实现载体，通过在Virtex-5 FPGA中设计逻辑实现高性能的DMA传输。FPGA中逻辑由Endpoint Block Plus IP核和系统逻辑组成。系统逻辑作为系统的核心使用发送引擎、接收引擎、端点内存和DMA引擎四个主要模块，完成了TLP的发送与接收，DMA传输的发起与控制、采集信号的存储等任务。
系统软件部分由负责硬件通信的驱动程序和负责人机交互的应用程序组成。为保证系统性能，驱动程序使用DriverStudio开发，采用直接事件通知模式保证软件响应时间，使用了两级数据缓冲机制保证文件的硬盘写入速度。应用程序使用Visual C++软件开发，使用了多线程技术与异步I／O技术提高了软件性能。
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