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生物体间关系可视化系统设计与实现_徐凉凉
在用户登陆管理模块， 用户只要登陆系统就可以把你的数据保存在 Web Server 上以便随时导入数据，系统可以保证数据的安全性，你存储的数据不会被其他用户所共享。在导入导出文件模块，允许用户输入有关生物网络的数据， 并在客户端迅速得到在线布局结果。用户也可以把得到的网络布局结果从新导出成所需要的格式的数据， 也可以把网络视图存储为 Jpg 或者 Bmp 格式。数据格式和访问方式的标准化有利于文件的导入导出以及服务器上数据的存储。可扩展标记语言 （extensible markup language，XML），是一种表示数据的工业标准，将数据与其表示相分离，XML 自推出以来， 尤其是在 1998 年 2 月成为 W3C 推荐标准以来受到了广泛的支持， 并且显示出了巨大的发展潜力。 BioXML 组织正在致力于将 XML 应用到生物信息学领域，以期统一数据表示和交换格式。中间件 （MiddleWare）技术对各种不兼容数据库和数据的集成和一致性访问提供了有效的解决方案。所以在我们设计系统的同时，我们期望开发出一种 XML 语言能够描述生物体间的关系，通过此系统能把 XML 语言可视化地转换成生物关系的网络拓补图。此种 XML 语言需要记录网络中各个节点（代表生物体），边（代表节点间的关系），布局以及其他信息。
此生物间关系可视化系统采用了快速网格布局算法作为其系统内核， 提供了交互的直观的图形界面用来直观显示算法布局结果方便用户交互式操作， 用户能够根据需要调整布局风格并对生物间关系作初步的分析。除此以外，该系统还实现了当今主流的生物数据库接口。
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