MPC5644A 具有两级存储器层次结构，包括 8 KB 指令缓存、192 KB 片上 SRAM 和 4 MB 内部闪存。MPC5644A 包括一个外部总线接口，以及一个只有在使用飞思卡尔垂直校准系统时才能访问的校准总线。