未来再生医学中心严谨的基因检测流程包括如下步骤:样本接收、核酸提取、文库构建、质量控制、测序分析、测序数据处理、遗传咨询师解读等标准步骤,为健康谱写精准说明书。
样本接收
采集的血液标本将被直接送到未来再生医学中心基因实验室进行分类,计算机录入,然后送入核酸提取区进行血浆分离程序。需要提到的是,未来再生医学中心的采血管是来自美国streck公司的核心技术,可在采血后常温14天内仍然保持血液不变质,管内排除了DNA的核酸酶的介导降解,有助于cfDNA的整体稳定。
核酸提取
负责cfDNA提取。在基因实验室血液通过高速离心的方式分离成血浆与血清,而在血浆中极其微量的cfDNA都将被完整保留下来。
这道程序首先有赖于未来再生医学中心使用的Eppendorf 德国低温高速离心机,该离心机具有转速稳定,冷却时间短的特点,在10分钟就内完成高效的血浆分离程序,保障标本在分离过程中不被损坏。再次,从已经分离的血浆中提取微量的cfDNA,未来再生医学中心采用美国Life公司的cfDNA提取盒,这个试剂盒能能让未来再生医学中心从每毫升血浆中提取出10ng的cfDNA,,也就是亿分之一克的含量。
文库构建
所谓文库构建就是在未来再生医学中心之前获取的每个cfDNA上在纳米级层次上连接上标准化DNA片段,通过这个步骤,cfDNA才能接入测序仪上样格式进行测试。这个过程也是通过测序仪配套的Life公司的文库构建试剂盒实现的,具有建库高效率,标准化的特点。
质量控制
最终测序之前,未来再生医学中心的检测环节是有质量控制步骤的。未来再生医学中心前端建立的文库,通过美国的 Agilent2100生物分析仪与美国Life 公司的Qubit3.0 荧光计,检测cfDNA是否已经正确连接上了标准化的DNA接头。这个识别过程也是纳米级的,可以对单独的未接上接头的cfDNA分子进行排查。如果不达标准,未来再生医学中心将进行重新建库,未来再生医学中心只对只有完整的接头的cfDNA进行测序分析。
测序分析
在测序分析区,cfDNA将被注入测序仪器当中,全自动化完成其序列分析工作。未来再生医学中心的测序仪采用的是美国Ion proton测序仪面向中国市场推出的DA8600型号,该机器在美国具有FDA认证,国内也符合CFDA标准,其高通量测序一次可测达80兆个DNA片段,得到10GB的DNA信息,完全可用于医疗级别的基因检测服务。
测序数据处理
对于测序所得的DNA序列信息,未来再生医学中心的专业生物信息工程师通过全球权威的UCSC,NCBI等基因数据库,对客户的DNA信息进行整合,与标准基因序列信息进行对比,得出突变位点。
遗传咨询师解读
未来再生医学中心的遗传咨询师根据这些位点,结合美国COSMIC,FDA等肿瘤突变、药物注册等数据库,出具标准化分析报告,为客户的解读其基因突变与疾病的关联。
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